Ion PGM 个人化操作基因组测序仪
Ion Torrent 个人化操作基因组测序仪(PGM),是市场上相较其他测序技术,更简单,经济和具有强大的可扩展性的测序平台。PGM台式系统的设计配合革新性的半导体芯片技术,使整个平台具有极高的扩展性和快速完成测序的性能。
Ion Torrent 技术通过专有的大规模并行半导体感应器, 对于 DNA 扩增时产生的离子流, 实现直接和实时的检测。 当试剂通过集成的流体通路进入 Ion Torrent 半导体芯片中,密布于芯片上的反应孔立即成为上百万个微反应体系。这种独特的流体体系,微体系机械设计和半导体的技术组合,使我们得以快速直接的将遗传信息翻译成数码的DNA测序结果,得到大量高质量的测序数据。
技术特点
◆ 成本低:设备成本与运行成本低
◆ 快速性:测序仅需1.5-2小时,一天内完成从样本到数据分析
◆ 高通量:能支持三款不同芯片Ion 314、Ion 316、Ion 318测序芯片以及多重文库
◆ 易操作:自动化程度高
◆ 易分析:配套多种软件, 满足各种需求的数据分析
◆ 长读长:单端可读取200bp、400bp
◆ 应用广:适用于DNA和RNA的测序
◆ 上样少:每管只需10 ng DNA或5 ng RNA起始样品
◆ 准确性:99.97%
主要应用
◆ 小基因组测序(如:微生物和病毒的从头测序和重测序;线粒体测序等)
◆ 扩增子重测序(如:16S宏基因组测序)
◆ 靶向重测序
◆ 基因组/全外显子验证
个人化操作基因组测序仪,配合Ion Torrent的半导体芯片,反应试剂盒和计算机服务器,数据分析套件,提供您最尖端的测序解决方案。
测序和分析流程
Ion Torrent 测序流程标准的要素包括,从准备随机片段的DNA 文库或者扩增子文库,到样本的PCR 扩增和在PGMTM的测序运行。
完成整个PGMTM的测序运行后,数据将会自动的导入专用的Torrent 预装分析套件的计算机服务器。在这里,原始的测序信号会转化成碱基序列并且以工业标准的SFF或者FASTAQ格式存储起来。这些测序数据可以通过众多商业化的软件进行后续不同应用的分析或者全新基因组的拼接。测序流程如下:
A. DNA/RNA 样本
B. 相应的文库准备
C. 测序样本准备
D. 测序反应
E. FASTQ 数据格式的测序结果
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